Ім'я "Неустрой" має слов'янське чоловіче особове походження, утворене від дієслова з використанням заперечної частки "не-". Вперше це ім'я було зафіксовано у 1603 році в похідній формі "Неустройко", який вказується як селянин з Дорогобузького повіту. Має аналог в сучасному російському прізвищі "Неустроев".